RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 NIM1KQ8IY84 436 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 E2F7Q96AV8 911 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 C17orf80Q9BSJ5 609 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF408Q9H9D4 720 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RRN3Q9NYV6 651 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NEMP1O14524 444 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NCAM2O15394 837 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GNA15P30679 374 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ERVK-24P63145 666 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CNTN1Q12860 1018 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GDPD5Q8WTR4 605 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NEK6Q9HC98 313 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ACADVLP49748 655 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MNTQ99583 582 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM79Q9BSE2 394 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GPAMQ9HCL2 828 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX9Q9Y5X1 595 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ADORA1P30542 326 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ALX1Q15699 326 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TNIP3Q96KP6 325 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SP110Q9HB58 689 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RGS18Q9NS28 235 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEB16A2A368 324 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SOAT2O75908 522 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT34O76011 436 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MFN2O95140 757 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CDH3P22223 829 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NR1H2P55055 460 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGADQ13349 1161 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKMY2Q8IV38 441 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 KYQ8NBH2 561 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NDNQ99608 321 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 IDH3BO43837 385 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NUDT2P50583 147 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFAF6Q330K2 333 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ECSITQ9BQ95 431 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GALNT8Q9NY28 637 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 STK32BQ9NY57 414 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A0B4J269 797 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC182A6NF36 153 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TLR2O60603 784 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CHN2P52757 468 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 OSTNP61366 133 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF844Q08AG5 666 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBB3Q13509 450 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 LIN54Q6MZP7 749 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC81Q6ZN84 652 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT78Q8N1N4 520 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 HPS1Q92902 700 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CEP170P1Q96L14 293 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 B3GALT6Q96L58 329 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CCSER1Q9C0I3 900 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PNMA3Q9UL41 463 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D12O60347 775 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 EPHB2P29323 1055 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEA4P43358 317 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM92BQ6ZTR7 304 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTL7BQ9Y614 415 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 H0YIN7 160 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RFX4Q33E94 735 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TTLL9Q3SXZ7 439 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 BTN2A1Q7KYR7 527 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 EID3Q8N140 333 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPRN2Q92932 1015 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CAMKK2Q96RR4 588 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 LY9Q9HBG7 655 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MROH7Q68CQ1 1323 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PDE8BO95263 885 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MYBL2P10244 700 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 FASP25445 335 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC24Q50LG9 513 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CLEC4GQ6UXB4 293 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GYS1P13807 737 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 VAMP7P51809 220 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MCL1Q07820 350 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SLITRK2Q9H156 845 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms