RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K14Q99558 947 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 EVPLLA8MZ36 301 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 FAM107AO95990 144 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 KRT8P05787 483 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 FDFT1P37268 417 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 PCYT1AP49585 367 aa23.2■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 GLRBP48167 497 aa23.19■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 CBWD1Q9BRT8 395 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 SUPT7LO94864 414 aa23.19■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF711Q9Y462 761 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 OXCT1P55809 520 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 RASSF10A6NK89 507 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 NUDT2P50583 147 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 PGS1Q32NB8 556 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 CNDP1Q96KN2 507 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 PRIM2P49643 509 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 CYP2C8P10632 490 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 VDRP11473 427 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL9Q3SXZ7 439 aa23.16■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 S100A5P33763 92 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC3Q13217 504 aa23.16■■□□□ 1.3
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