RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 WEE2P0C1S8 567 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RXRGP48443 463 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 STAT2P52630 851 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 OXCT1P55809 520 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NUF2Q9BZD4 464 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 HALP42357 657 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 UGT2A3Q6UWM9 527 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC43Q8N309 656 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SLCO2A1Q92959 643 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 APOPT1Q96IL0 206 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 KREMEN1Q96MU8 473 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 EURLQ9NYK6 297 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 A0A088AWK7 358 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GIPC1O14908 333 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB5O15062 677 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ALOX15BO15296 676 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CRTAMO95727 393 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GSTO1P78417 241 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ANKDD1AQ495B1 522 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FNBP1LQ5T0N5 605 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NUP93Q8N1F7 819 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 C17orf50Q8WW18 174 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM17Q9Y577 477 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1B0GTW7 788 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM247A6NEH6 219 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM221A6NGB7 291 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PIK3R2O00459 728 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SLURP2P0DP57 97 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SLC5A3P53794 718 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SULT2A1Q06520 285 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DMPKQ09013 629 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MORF4L2Q15014 288 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MSS51Q4VC12 460 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PARP10Q53GL7 1025 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MROH9Q5TGP6 573 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 AAGABQ6PD74 315 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TDRPQ86YL5 185 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FOXP3Q9BZS1 431 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 INIPQ9NRY2 104 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NDUFB5O43674 189 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SMIM18P0DKX4 95 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FGFR3P22607 806 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NRLP54845 237 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CCNIQ14094 377 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 EFHC2Q5JST6 749 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TTC13Q8NBP0 860 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 POMPQ9Y244 141 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MYH11P35749 1972 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ATP8B3O60423 1300 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CLUHO75153 1309 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DENND3A2RUS2 1198 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 HYIQ5T013 277 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RNF111Q6ZNA4 994 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PPP4R1Q8TF05 950 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 EME1Q96AY2 570 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CDH22Q9UJ99 828 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 P4HA2O15460 535 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms