RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CLUHO75153 1309 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 BAG2O95816 211 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PGM1P36871 562 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 VHLP40337 213 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 COG7P83436 770 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 RASA2Q15283 850 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 LRRC4Q9HBW1 653 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CNTNAP1P78357 1384 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 M0QZ92 97 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 STX3Q13277 289 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 NAB1Q13506 487 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 SMTNL2Q2TAL5 461 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 BSPRYQ5W0U4 402 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 LRRC6Q86X45 466 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 HAO1Q9UJM8 370 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.23□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PSMD3O43242 534 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 GH1P01241 217 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 LAMC2Q13753 1193 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 C12orf42Q96LP6 360 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 F8VP50 259 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ACADSP16219 412 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TAC1P20366 129 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 SLC12A2P55011 1212 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 DPYSL3Q14195 570 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP18Q8N392 663 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ITGB3P05106 788 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 C7orf31Q8N865 590 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CCNYQ8ND76 341 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TMEM237Q96Q45 408 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 HEY2Q9UBP5 337 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TNFSF13BQ9Y275 285 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 A8MXQ7 604 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA8RI6L899 631 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CD4P01730 458 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CAPSQ13938 189 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 WLSQ5T9L3 541 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 VSTM1Q6UX27 236 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 RASSF3Q86WH2 238 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TNIP3Q96KP6 325 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 NAT9Q9BTE0 207 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 LRMDAQ9H2I8 198 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 NDE1Q9NXR1 346 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 DPP3Q9NY33 737 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TLK1Q9UKI8 766 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 C2CD2LO14523 706 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 STAG3L1P0CL83 205 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 NR2C2P49116 596 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 EFHC1Q5JVL4 640 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TCP10LQ8TDR4 215 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 GINS2Q9Y248 185 aa9.21□□□□□ -0.93
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