RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 HHLA1C9JL84 531 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ADORA2BP29275 332 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 CDC25CP30307 473 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 TDGQ13569 410 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 KRT31Q15323 416 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 TAF12Q16514 161 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 GPR88Q9GZN0 384 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 TRPV4Q9HBA0 871 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 CNTN6Q9UQ52 1028 aa23.63■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 SYCE3A1L190 88 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 NARSO43776 548 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ANXA13P27216 316 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 SMARCD2Q92925 531 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 RSPRY1Q96DX4 576 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 TASP1Q9H6P5 420 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ATP8B3O60423 1300 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ZNF132P52740 706 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K7CLP57077 242 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 GPR158Q5T848 1215 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 TMEM270Q6UE05 265 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 MTSS1LQ765P7 747 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 NUP93Q8N1F7 819 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 TFAP2BQ92481 460 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 KXD1Q9BQD3 176 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 FAM92AA1XBS5 289 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ECI2O75521 394 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 CALCAP01258 141 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 FAM200BP0CF97 657 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 WEE1P30291 646 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 VIPR2P41587 438 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 TXNDC8Q6A555 127 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ELSPBP1Q96BH3 223 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 LRRC3BQ96PB8 259 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 DUSP16Q9BY84 665 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 VPS16Q9H269 839 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 DUSP12Q9UNI6 340 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 PATJQ8NI35 1801 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 SLC5A3P53794 718 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 IQCB1Q15051 598 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 TTC30AQ86WT1 665 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 UBALD2Q8IYN6 164 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ASIC4Q96FT7 647 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 PAEPP09466 180 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 VDRP11473 427 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 NPR3P17342 541 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 TAF10Q12962 218 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 VITQ6UXI7 678 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 TRIM67Q6ZTA4 783 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 MON1AQ86VX9 555 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A12Q96S37 553 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ZFP14Q9HCL3 533 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1257Q9ULG3 409 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 ZNF840PA6NDX5 716 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SOBPA7XYQ1 873 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 BECN2A8MW95 431 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 O00370 1275 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF12O95522 483 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 ATP1A3P13637 1013 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 YWHAQP27348 245 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 PGFP49763 221 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 GPC5P78333 572 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC14Q08ET2 396 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 NFKBIBQ15653 356 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 PKDCCQ504Y2 493 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 CMTM8Q8IZV2 173 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms