RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pde2aQ922S4 916 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wbp11Q923D5 641 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rilpl2Q99LE1 197 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Alpk3Q924C5 1678 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scn4aQ9ER60 1841 aa13.35□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aff1O88573 1216 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap17Q3UIA2 846 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r13lQ5I1X5 824 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Khdrbs1Q60749 443 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hdac11Q91WA3 347 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mccc1Q99MR8 717 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Erap1Q9EQH2 930 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrch1P62046 709 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spryd7Q3TFQ1 196 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cage1Q5IR70 849 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itih1Q61702 907 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HpseQ6YGZ1 535 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CarfQ8VHI4 689 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nt5c3aQ9D020 331 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc182Q9D9C6 152 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B4galt5Q9JMK0 388 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lipo2D3YY49 398 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc8a1P70414 970 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GsapQ3TCV3 858 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Orc2Q60862 576 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stambpl1Q76N33 436 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vipas39Q8BGQ1 491 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rtp1Q8C8C1 263 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ipo11Q8K2V6 975 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Angel1Q8VCU0 667 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2c55Q9D816 490 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tulp2P46686 562 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prom2Q3UUY6 835 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SpdyaQ5IBH7 310 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc24Q8BYG0 334 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl36Q8R124 613 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mapk13Q9Z1B7 366 aa13.34□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AspgA0JNU3 564 aa13.33□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc38a5Q3U1J0 479 aa13.33□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vgll2Q8BGW8 322 aa13.33□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Glis1Q8K1M4 789 aa13.33□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abhd8Q8R0P8 439 aa13.33□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem86aQ9D8N3 241 aa13.33□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GraspQ9JJA9 392 aa13.33□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ror2Q9Z138 944 aa13.33□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr414E9Q5P8 317 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpina3kP07759 418 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acvr2bP27040 536 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 YwhazP63101 245 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankmy2Q3TPE9 440 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc30a9Q5IRJ6 567 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnajc6Q80TZ3 938 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nipal1Q8BMW7 416 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mill1Q8HWE7 395 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc71Q9D3W5 558 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf609Q8BZ47 1413 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PtpreP49446 699 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsd17b4P51660 735 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ksr1Q61097 873 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp11bQ6DFW5 1175 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnaseh2bQ80ZV0 308 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tceal1Q921P9 165 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AllcQ9JHX6 414 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myh1Q5SX40 1942 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dhtkd1A2ATU0 921 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6133B2RY53 190 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hcn2O88703 863 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc153P0C7Q1 202 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aldh1a1P24549 501 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pde1aQ61481 565 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Casc4Q6P2L7 435 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wnk4Q80UE6 1222 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8BWG4 1187 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Camkk2Q8C078 588 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rasal3Q8C2K5 1041 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HyiQ8R1F5 277 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HnmtQ91VF2 295 aa13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx47Q9CWX9 455 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4302E9PX25 294 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21973F6WEZ7 68 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc9Q3V038 219 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acbd5Q5XG73 508 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q6GQU0 248 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam120bQ6RI63 786 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Enoph1Q8BGB7 257 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kctd2Q8CEZ0 266 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf208Q8K0W3 265 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ChiaQ91XA9 473 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc12a9Q99MR3 914 aa13.32□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Asb11Q9CQ31 323 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.3 ms