RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W SRX1P36077 127 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W RPB11P38902 120 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W FLX1P40464 311 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W LSM8P47093 109 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W YGL230CP53074 147 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W YML079WQ03629 201 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W YPR195CQ06594 109 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W RAD28Q12021 506 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W ATG41Q12048 136 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W SCS22Q6Q595 175 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W UBR1P19812 1950 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W YCR050CP25630 102 aa3.36□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W MPC1P53157 130 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W YHP1Q04116 353 aa3.36□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W SPS2P08459 502 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W MIG1P27705 504 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W MPM1P40364 252 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W NSE4P43124 402 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W YJR146WP47174 117 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W AGA2P32781 87 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W YEL067CP39978 195 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W UPS1Q05776 175 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W YLR042CQ07990 161 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR104WYKR104W YGL041W-AP0C5N3 154 aa3.33□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W INO4P13902 151 aa3.33□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W CLB6P32943 380 aa3.33□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YGR269WP40326 108 aa3.33□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W ERG25P53045 309 aa3.33□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W ZEO1Q08245 113 aa3.33□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W SEC11P15367 167 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W DIE2P50076 525 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W RAF1Q06891 181 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W RTR2Q12378 196 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W VAR1P02381 398 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W SDH4P37298 181 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W SVP26P38869 228 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YAL064WP39711 94 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YMR252CQ04814 134 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W KEI1Q06346 221 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YDL241WQ07738 123 aa3.31□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W KNH1P50112 268 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W SOM1Q05676 74 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YOR385WQ08909 290 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YDL157CQ12082 118 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W OCA6Q12454 224 aa3.3□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W DYN1P36022 4092 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W STT4P37297 1900 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W COX8P04039 78 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W TMA19P35691 167 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YHL042WP38729 150 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YHR022CP38763 256 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W DAD3P69850 94 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W RCE1Q03530 315 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W IRC19Q07843 230 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W EMC6Q12431 108 aa3.29□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W STF2P16965 84 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YAR029WP39549 74 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YGR164WP53291 111 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W DAD4P69851 72 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W CYT2Q00873 224 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W PRM7Q12459 698 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR104WYKR104W YCR099CP25657 155 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W FMT1P32785 401 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W QCR10P37299 77 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W YBR090CP38253 122 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W CCS1P40202 249 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W YJL144WP47009 104 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W VPS68Q12016 184 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W YCL001W-BQ96VH2 84 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W POP3P53833 195 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W MRPL44P19956 98 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W FYV5P25585 152 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W PAM16P42949 149 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W FIT2Q08906 153 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W YMR030W-AQ3E760 96 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W YOR376W-AQ3E805 51 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W YPR096CO13587 100 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W MDM35O60200 86 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W COX5BP00425 151 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W RPL43BP0CX26 92 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W BAT2P47176 376 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W YPR153WQ06537 140 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W GTT2Q12390 233 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W HAP3P13434 144 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W UBC5P15732 148 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W SRL3P36167 246 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W YFR035CP43608 114 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR104WYKR104W MET31Q03081 177 aa3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 6.4 ms