RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 SOBPA7XYQ1 873 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 LRRN2O75325 713 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 GRIK1P39086 918 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 NDST1P52848 882 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 CBWD6Q4V339 395 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 CBWD3Q5JTY5 395 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 CBWD5Q5RIA9 395 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 CRYBG2Q8N1P7 616 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 C8orf48Q96LL4 319 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 B3GNT5Q9BYG0 378 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 CACNA1HO95180 2353 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 ANXA13P27216 316 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 CYP4F8P98187 520 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 PFKPQ01813 784 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 MFSD1Q9H3U5 465 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.831e-16■■■■■ 250
PMS1-220ENST00000618056 HMGXB4Q9UGU5 601 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 KRBA1A5PL33 1030 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 VIPR2P41587 438 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 STX17P56962 302 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 CCDC40Q4G0X9 1142 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 VITQ6UXI7 678 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 ARHGEF3Q9NR81 526 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 F8VP50 259 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 PMM2O15305 246 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 NPR3P17342 541 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 PSMC3P17980 439 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 CLCN5P51795 746 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 MARSP56192 900 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 ACOT1Q86TX2 421 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 MFSD6LQ8IWD5 586 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 SLC46A2Q9BY10 475 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 KCNH6Q9H252 994 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 TMEM30AQ9NV96 361 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 OBP2AQ9NY56 170 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 EHD2Q9NZN4 543 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 CA14Q9ULX7 337 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 ATP8B3O60423 1300 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 COL4A2P08572 1712 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 PATJQ8NI35 1801 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 CLDN5O00501 218 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 TADA3O75528 432 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 GNA14O95837 355 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 CACNA2D1P54289 1103 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 WDR44Q5JSH3 913 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 PAQR9Q6ZVX9 377 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 FAM35AQ86V20 835 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 TTC39CQ8N584 583 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 MLKLQ8NB16 471 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 TTLL2Q9BWV7 592 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 NCANO14594 1321 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 MIA3Q5JRA6 1907 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 HEPACAM2A8MVW5 462 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CILPO75339 1184 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 AVPR2P30518 371 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 HELZP42694 1942 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 FMO5P49326 533 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 VCPP55072 806 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 GRM2Q14416 872 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 MON1AQ86VX9 555 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 FUKQ8N0W3 1084 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 DNASE1L2Q92874 299 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 RSPRY1Q96DX4 576 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 NT5C1AQ9BXI3 368 aa26.45■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 FCHO2Q0JRZ9 810 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CMTM8Q8IZV2 173 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 SMARCD1Q96GM5 515 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 TWNKQ96RR1 684 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 TRPV5Q9NQA5 729 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 STARD6P59095 220 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 ORC1Q13415 861 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 TRIM59Q8IWR1 403 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 MAB21L3Q8N8X9 362 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 FLCNQ8NFG4 579 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 WHAMMQ8TF30 809 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 IRF7Q92985 503 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 SHDQ96IW2 340 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 MED10Q9BTT4 135 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 BRD9Q9H8M2 597 aa26.43■■□□□ 1.82
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