RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
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SGMS1-208ENST00000608287 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.64■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 SLC32A1Q9H598 525 aa20.64■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.64■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.64■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 ODC1P11926 461 aa20.63■□□□□ 0.89
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SGMS1-208ENST00000608287 TCEAL3Q969E4 200 aa20.63■□□□□ 0.89
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SGMS1-208ENST00000608287 SENP8Q96LD8 212 aa20.63■□□□□ 0.89
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SGMS1-208ENST00000608287 EML5Q05BV3 1969 aa20.63■□□□□ 0.89
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SGMS1-208ENST00000608287 DPYDQ12882 1025 aa20.62■□□□□ 0.89
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SGMS1-208ENST00000608287 ACDQ96AP0 544 aa20.62■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.62■□□□□ 0.89
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SGMS1-208ENST00000608287 RNF40O75150 1001 aa20.58■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM16O95361 564 aa20.58■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 TNNC2P02585 160 aa20.58■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 CYP11A1P05108 521 aa20.58■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 OR4Q2P0C623 313 aa20.58■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 GABRR2P28476 465 aa20.58■□□□□ 0.89
SGMS1-208ENST00000608287 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.58■□□□□ 0.89
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