RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.67□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.67□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 NME7Q9Y5B8 376 aa8.67□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.67□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SCINQ9Y6U3 715 aa8.67□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 USP27XA6NNY8 438 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 M0QYV0 167 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 KIF5CO60282 957 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 TBC1D4O60343 1298 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SOD2P04179 222 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 CYP1A2P05177 515 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 FOSL2P15408 326 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 LMO2P25791 158 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ARHGAP25P42331 645 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 GPD2P43304 727 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ACADSBP45954 432 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PLA2G4AP47712 749 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 EPHB4P54760 987 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 GPC5P78333 572 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 TAP1Q03518 808 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 USP41Q3LFD5 358 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 FIBCD1Q8N539 461 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 TRIM58Q8NG06 486 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM169Q96HH4 297 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 HSFY1Q96LI6 401 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SAMD11Q96NU1 681 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ALS2CR12Q96Q35 445 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 TTPALQ9BTX7 342 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 DPEP3Q9H4B8 488 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ABCB6Q9NP58 842 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 CHST7Q9NS84 486 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 MAFFQ9ULX9 164 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 LZTS1Q9Y250 596 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 RCCD1A6NED2 376 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 C1RP00736 705 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 LINC00271P0C7V0 271 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 NPR3P17342 541 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 MAGEA11P43364 429 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 DSG1Q02413 1049 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 UBE3AQ05086 875 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PTP4A2Q12974 167 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PDCLQ13371 301 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PTPN14Q15678 1187 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 LIN9Q5TKA1 542 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 NAA35Q5VZE5 725 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ARCQ7LC44 396 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ERICH1Q86X53 443 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 PLPP6Q8IY26 295 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 FUKQ8N0W3 1084 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SCML4Q8N228 414 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 C12orf29Q8N999 325 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 C3orf20Q8ND61 904 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 HASPINQ8TF76 798 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF653Q96CK0 615 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 DUSP16Q9BY84 665 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM5B-210ENST00000602511 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms