RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR20Q99678 358 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 MTMR12Q9C0I1 747 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 CHST7Q9NS84 486 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 CISHQ9NSE2 258 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPRFP10586 1907 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM191CA6NGB0 347 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM189A1O60320 539 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 CDH16O75309 829 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ADH1AP07327 375 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 MCF2P10911 925 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 CD58P19256 250 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 PROZP22891 400 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 TMOD1P28289 359 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ATICP31939 592 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC24CP53992 1094 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 TAS2R40P59535 323 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 MYL6P60660 151 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 POU5F1BQ06416 359 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 VAC14Q08AM6 782 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 AUHQ13825 339 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKG1Q13976 671 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 PCGF5Q86SE9 256 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 CPNE8Q86YQ8 564 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 FNIP1Q8TF40 1166 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 MCEEQ96PE7 176 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 SLITRK1Q96PX8 696 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 LHX5Q9H2C1 402 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNCQ9H7C4 482 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 LGALS13Q9UHV8 139 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 FZD1Q9UP38 647 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFSF13BQ9Y275 285 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 COL1A2P08123 1366 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGEB2O15479 319 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 LIASO43766 372 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ACSL3O95573 720 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXC6P09630 235 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 GHRP10912 638 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 CD19P15391 556 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 DRD4P21917 467 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 MARK3P27448 753 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFSF9P41273 254 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ASPAP45381 313 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 LIG3P49916 1009 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 CCNA1P78396 465 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 IFT88Q13099 833 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 MORF4L2Q15014 288 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ACAP1Q15027 740 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 TFDP3Q5H9I0 405 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR78Q5VTH9 848 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 HEMGNQ9BXL5 484 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM7Q9C029 511 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAI2Q9GZS0 605 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 FZD8Q9H461 694 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 ELP3Q9H9T3 547 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 CYLDQ9NQC7 956 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 SENP1Q9P0U3 644 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms