RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	DKK4	Q9UBT3	224 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	HPSE	Q9Y251	543 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	DYTN	A2CJ06	578 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	NOBOX	O60393	691 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	INMT	O95050	263 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	GNAT2	P19087	354 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	AKT1	P31749	480 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	ADD2	P35612	726 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	DDIT3	P35638	169 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	LIFR	P42702	1097 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SEC24C	P53992	1094 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	CTSW	P56202	376 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	WNT3	P56703	355 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	MC2R	Q01718	297 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	TCF15	Q12870	199 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	IQCB1	Q15051	598 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	BTBD16	Q32M84	506 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	DOK3	Q7L591	496 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	BORCS6	Q96GS4	357 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SMO	Q99835	787 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SIK2	Q9H0K1	926 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608		A6NLC8	198 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	CCP110	O43303	1012 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SRGAP2	O75044	1071 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	COQ9	O75208	318 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	AR	P10275	920 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	RXRA	P19793	462 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	CR2	P20023	1033 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	NTSR1	P30989	418 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	MAN1A1	P33908	653 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	BCAT1	P54687	386 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	INSC	Q1MX18	579 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	GNRHR2	Q96P88	292 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	OR14A2	Q96R54	314 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	MED15	Q96RN5	788 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	LMF1	Q96S06	567 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	RTKN	Q9BST9	563 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608		J3KTA2	159 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	RGS10	O43665	173 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM155B	O75949	473 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	HGF	P14210	728 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	AP2B1	P63010	937 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SCAP	Q12770	1279 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	GPS1	Q13098	491 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	HYI	Q5T013	277 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	HERVK_113	Q902F9	699 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	ST8SIA2	Q92186	375 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATP9B-223	ENST00000590608	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		5.67	□□□□□ -1.5

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