RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 PNOCQ13519 176 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 NCOA4Q13772 614 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF516Q92618 1163 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 DNASE1L2Q92874 299 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 RSPRY1Q96DX4 576 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 BCO2Q9BYV7 579 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 LTB4R2Q9NPC1 389 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CDH9Q9ULB4 789 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PIAS3Q9Y6X2 628 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC38A8A6NNN8 435 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 A8MXQ7 604 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 PDXKO00764 312 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 GABRDO14764 452 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 GFRA3O60609 400 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 OBSL1O75147 1896 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 RHOBTB3O94955 611 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM49P0CI25 452 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM49CP0CI26 452 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT13P13646 458 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 AVPR1AP37288 418 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 NLRP12P59046 1061 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 DLG4P78352 724 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 TXNDC8Q6A555 127 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 DPH6Q7L8W6 267 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 MFSD6LQ8IWD5 586 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA18Q8TC71 538 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 TATDN2Q93075 761 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 E2F7Q96AV8 911 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 MED10Q9BTT4 135 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 TASP1Q9H6P5 420 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 IL21Q9HBE4 155 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCB6Q9NP58 842 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 WDR70Q9NW82 654 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 CLDN5O00501 218 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ABL1P00519 1130 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 CKMP06732 381 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 GLULP15104 373 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 CCNE1P24864 410 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 SOX9P48436 509 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 VAMP7P51809 220 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 CDH8P55286 799 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ORC1Q13415 861 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM3CQ92520 227 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 EEF2KMTQ96G04 330 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 PCED1BQ96HM7 432 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 PKMYT1Q99640 499 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 IMPG2Q9BZV3 1241 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 COL4A2P08572 1712 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 DENND4CQ5VZ89 1909 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 F8VP50 259 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 NCAM2O15394 837 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 LAMTOR5O43504 91 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 P4HA1P13674 534 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ATICP31939 592 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 GCLMP48507 274 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 AP3M2P53677 418 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 TNK2Q07912 1038 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNB1Q14721 858 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM171BQ6P995 826 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 C1orf210Q8IVY1 113 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 SMARCE1Q969G3 411 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms