RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	TMC2	Q8TDI7	906 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PCED1B	Q96HM7	432 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	EHD2	Q9NZN4	543 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479		R4GN57	208 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	PIEZO1	Q92508	2521 aa		10.03	□□□□□ -0.8
KIFC3-231	ENST00000567479	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM66	O15016	1216 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L7	P0C7H9	530 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CHRNB1	P11230	501 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	P4HA1	P13674	534 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	HDC	P19113	662 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SOX9	P48436	509 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	VAMP7	P51809	220 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CDH8	P55286	799 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TNK2	Q07912	1038 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	MTAP	Q13126	283 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP2R5D	Q14738	602 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF699	Q32M78	642 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SV2A	Q7L0J3	742 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ADSSL1	Q8N142	457 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	C8orf48	Q96LL4	319 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	IER2	Q9BTL4	223 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CHRD	Q9H2X0	955 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CCL26	Q9Y258	94 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	NME7	Q9Y5B8	376 aa		10.02	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479		F8VP50	259 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	MAPK13	O15264	365 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TADA3	O75528	432 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	VNN1	O95497	513 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT13	P13646	458 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	NR2F2	P24468	414 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CTH	P32929	405 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP3CC	P48454	512 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PDE6C	P51160	858 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	AMPD2	Q01433	879 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ADAM9	Q13443	819 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	RUNX3	Q13761	415 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC32	Q14392	662 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	NFIL3	Q16649	462 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ZACN	Q401N2	412 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TSSK4	Q6SA08	328 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TAF4B	Q92750	862 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TNIP3	Q96KP6	325 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CACNA1H	O95180	2353 aa		10.01	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	COL4A3	Q01955	1670 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	C2orf78	A6NCI8	922 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CLDN5	O00501	218 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	AKAP3	O75969	853 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ABL1	P00519	1130 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CKM	P06732	381 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PFKL	P17858	780 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	RAP1GAP	P47736	663 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CXCL12	P48061	93 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CCR3	P51677	355 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	NRL	P54845	237 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	USP46	P62068	366 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PON2	Q15165	354 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PDGFRL	Q15198	375 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81

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