RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557397.5

TIMM9-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 4

Gene TIMM9, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-210	ENST00000557397	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397		H7C1Q1	480 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	BCAR3	O75815	825 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	TJP3	O95049	919 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	PDE8B	O95263	885 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	TPTE	P56180	551 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	PGS1	Q32NB8	556 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	EXOC3	O60645	756 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	GRP	P07492	148 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	VIPR2	P41587	438 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	KCNJ5	P48544	419 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	SOX8	P57073	446 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	TERB1	Q8NA31	727 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	XPR1	Q9UBH6	696 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TIMM9-210	ENST00000557397	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	LRPAP1	P30533	357 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397		Q4G0T1	1027 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	WASF1	Q92558	559 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC35A4	Q96G79	324 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SNX18	Q96RF0	628 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	GABRQ	Q9UN88	632 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397		E5RJQ4	531 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	FCHO1	O14526	889 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	INSIG1	O15503	277 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	IGSF3	O75054	1194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	IL33	O95760	270 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	PRKCB	P05771	671 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SNHG28	P0DPA3	235 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	IL1R2	P27930	398 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	PDE6C	P51160	858 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SATB1	Q01826	763 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	TMX2	Q9Y320	296 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6	2e-6	■■■■□ 19.9
TIMM9-210	ENST00000557397	USP1	O94782	785 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	CSF1R	P07333	972 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	CYP2C9	P11712	490 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	MYO1E	Q12965	1108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	LRRC41	Q15345	812 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	CIPC	Q9C0C6	399 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	MYMK	A6NI61	221 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SOCS2	O14508	198 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	FGB	P02675	491 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	TH	P07101	528 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	AKAP5	P24588	427 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	CCKBR	P32239	447 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	RENBP	P51606	427 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	UCP3	P55916	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	LY6K	Q17RY6	165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	TMEM240	Q5SV17	173 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIMM9-210	ENST00000557397	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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