RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCSK1P29120 753 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXC13P31276 330 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYKP43405 635 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AFMP43652 599 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPH6Q7L8W6 267 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAB3Q8WWW8 586 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHFRQ96EP1 664 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LOXL4Q96JB6 756 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARSAP15289 507 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GALK1P51570 392 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OSTM1Q86WC4 334 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FSIP1Q8NA03 581 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STKLD1Q8NE28 680 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SIX4Q9UIU6 781 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE4BO95155 1302 aa20.78■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EGFP01133 1207 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP17L7P0C7H9 530 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAGEA11P43364 429 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYO1EQ12965 1108 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTF1Q14872 753 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SURF1Q15526 300 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO43Q4G163 708 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM171BQ6P995 826 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPD1LQ8N335 351 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPA6Q8N4T0 437 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIN3Q8TB24 985 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EXOC1Q9NV70 894 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INTS13Q9NVM9 706 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF233A6NK53 670 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AXIN1O15169 862 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TADA3O75528 432 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKAP3O75969 853 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GJA4P35212 333 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM84AQ96KN4 292 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ECT2Q9H8V3 914 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.76■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GDF9O60383 454 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF40O75150 1001 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CKMP06732 381 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADRB1P08588 477 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAP1GAPP47736 663 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EHHADHQ08426 723 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF77Q15935 545 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPM1JQ5JR12 505 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP2A3Q93084 1043 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAGE5Q96GU1 130 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HPDLQ96IR7 371 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC22A12Q96S37 553 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDH9Q9ULB4 789 aa20.75■□□□□ 0.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms