RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552548.5

PFDN5-217, Transcript of prefoldin subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene PFDN5, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5-217ENST00000552548 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.51□□□□□ -1.21
PFDN5-217ENST00000552548 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.51□□□□□ -1.21
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PFDN5-217ENST00000552548 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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PFDN5-217ENST00000552548 TBX10O75333 385 aa7.5□□□□□ -1.21
PFDN5-217ENST00000552548 GRAP2O75791 330 aa7.5□□□□□ -1.21
PFDN5-217ENST00000552548 AP1G2O75843 785 aa7.5□□□□□ -1.21
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PFDN5-217ENST00000552548 ZNF280DQ6N043 979 aa7.5□□□□□ -1.21
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PFDN5-217ENST00000552548 TMEM86AQ8N2M4 240 aa7.5□□□□□ -1.21
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PFDN5-217ENST00000552548 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PFDN5-217ENST00000552548 PLVAPQ9BX97 442 aa7.5□□□□□ -1.21
PFDN5-217ENST00000552548 MIS12Q9H081 205 aa7.5□□□□□ -1.21
PFDN5-217ENST00000552548 GOLPH3Q9H4A6 298 aa7.5□□□□□ -1.21
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PFDN5-217ENST00000552548 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.5□□□□□ -1.21
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PFDN5-217ENST00000552548 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
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PFDN5-217ENST00000552548 TCF4P15884 667 aa7.49□□□□□ -1.21
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PFDN5-217ENST00000552548 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.49□□□□□ -1.21
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PFDN5-217ENST00000552548 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.49□□□□□ -1.21
PFDN5-217ENST00000552548 EMC1Q8N766 993 aa7.49□□□□□ -1.21
PFDN5-217ENST00000552548 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.49□□□□□ -1.21
PFDN5-217ENST00000552548 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.49□□□□□ -1.21
PFDN5-217ENST00000552548 RIN3Q8TB24 985 aa7.49□□□□□ -1.21
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