RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549279.1

TPCN1-212, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPCN1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-212ENST00000549279 HEPACAM2A8MVW5 462 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 NPR3P17342 541 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 WEE1P30291 646 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 VIPR2P41587 438 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 NUBP1P53384 320 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 GRM2Q14416 872 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 DNASE1L2Q92874 299 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 IRF7Q92985 503 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 C8orf48Q96LL4 319 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 96.1
TPCN1-212ENST00000549279 RAB20Q9NX57 234 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 AOC1P19801 751 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 NDST1P52848 882 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 PRKCQQ04759 706 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 PAK1Q13153 545 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 WDR44Q5JSH3 913 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 TTI2Q6NXR4 508 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 YAF2Q8IY57 180 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 MED10Q9BTT4 135 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 OBP2AQ9NY56 170 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 PTPRDP23468 1912 aa21.44■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 F8VP50 259 aa21.43■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 ZNF263O14978 683 aa21.43■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 GDI1P31150 447 aa21.43■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 AVPR1AP37288 418 aa21.43■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 INCA1Q0VD86 236 aa21.43■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 ACOT1Q86TX2 421 aa21.43■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CMTM8Q8IZV2 173 aa21.43■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.43■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.43■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.43■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CLDN5O00501 218 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 STARD6P59095 220 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CBWD6Q4V339 395 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 FAM35AQ86V20 835 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 TTC39CQ8N584 583 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 SLC35C1Q96A29 364 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 GBP4Q96PP9 640 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 TRPV5Q9NQA5 729 aa21.42■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 GNA14O95837 355 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 FCHO2Q0JRZ9 810 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 IER5LQ5T953 404 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 TXNDC8Q6A555 127 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 MON1AQ86VX9 555 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 SEMA4DQ92854 862 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 DENND4CQ5VZ89 1909 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 OBSL1O75147 1896 aa21.41■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 NCANO14594 1321 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CHADO15335 359 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 TADA3O75528 432 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 PRAMEF12O95522 483 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 CD58P19256 250 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 PPP3CCP48454 512 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 STX17P56962 302 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 ORC1Q13415 861 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 BPIFB1Q8TDL5 484 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 RSPRY1Q96DX4 576 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.4■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.39■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.39■■□□□ 1.01
TPCN1-212ENST00000549279 PI15O43692 258 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms