RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 DEFB118Q96PH6 123 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 NCAPGQ9BPX3 1015 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 DUSP16Q9BY84 665 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 FUT8Q9BYC5 575 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 UBXN6Q9BZV1 441 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 LRRC19Q9H756 370 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 EPB41L5Q9HCM4 733 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 ST7Q9NRC1 585 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 HOMER3Q9NSC5 361 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 FAM49BQ9NUQ9 324 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 ASNSD1Q9NWL6 643 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 PCYOX1Q9UHG3 505 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 CDH9Q9ULB4 789 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 ARHGEF37A1IGU5 675 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 C2CD4BA6NLJ0 364 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 E5RJQ4 531 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 M0QZQ0 153 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 PITPNM1O00562 1244 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 DPYSL4O14531 572 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 ENPP3O14638 875 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 HCRTO43612 131 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 ZMYND10O75800 440 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 GABBR2O75899 941 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 POMCP01189 267 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 KRT7P08729 469 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 CCDC130P13994 396 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 GPD1P21695 349 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 PTPN7P35236 360 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 PCK1P35558 622 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 PTGIRP43119 386 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 PLA2G4AP47712 749 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 DRG2P55039 364 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 PLCB3Q01970 1234 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 GUCY2DQ02846 1103 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 CUL1Q13616 776 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 GPNMBQ14956 572 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 MTFR1Q15390 333 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 PAQR9Q6ZVX9 377 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 FUKQ8N0W3 1084 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 C3orf58Q8NDZ4 430 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 SLC2A14Q8TDB8 520 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 LINC01599Q8WXQ3 324 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 KCTD13Q8WZ19 329 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 SEPT8Q92599 483 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 LPIN3Q9BQK8 851 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 CNPY3Q9BT09 278 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 RNF208Q9H0X6 261 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 TMEM161AQ9NX61 479 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 OGFRQ9NZT2 677 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 AMACRQ9UHK6 382 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 DSEQ9UL01 958 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 EFR3BQ9Y2G0 817 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-209ENST00000547449 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CASTOR2A6NHX0 329 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TULP2O00295 520 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 NBNO60934 754 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 ATP2C2O75185 946 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 LRCH4O75427 683 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 RNF8O76064 485 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 B3GAT3O94766 335 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 ODC1P11926 461 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 PDGFRAP16234 1089 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TYMPP19971 482 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 PCSK1P29120 753 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 ADORA2BP29275 332 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 COILP38432 576 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SSR1P43307 286 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 FNTAP49354 379 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 RGS7P49802 495 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SLC8A3P57103 927 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 DSC1Q08554 894 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 NNTQ13423 1086 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CCNG2Q16589 344 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 NOMO2Q5JPE7 1267 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 KIAA0319Q5VV43 1072 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 EMBQ6PCB8 327 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 OLFML1Q6UWY5 402 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SLC26A9Q7LBE3 791 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms