RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520712.1

CLVS1-206, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLVS1, Length 661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-206ENST00000520712 CLRN1P58418 232 aa4.6□□□□□ -1.67
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CLVS1-206ENST00000520712 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa4.58□□□□□ -1.68
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