RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 GPR88Q9GZN0 384 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ISCUQ9H1K1 167 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 VCX3BQ9H321 246 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PARVAQ9NVD7 372 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 LACTBL1A8MY62 500 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CALB1P05937 261 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NFICP08651 508 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FAM153BP0C7A2 387 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC159P0C7I6 412 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PYGMP11217 842 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CHRNB2P17787 502 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CCT8P50990 548 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MAP7Q14244 749 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF6Q15052 776 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CNGA3Q16281 694 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FAM153CQ494X1 144 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TLK2Q86UE8 772 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF677Q86XU0 584 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM192Q8IY95 271 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 UBA3Q8TBC4 463 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KAT6AQ92794 2004 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GRAP2O75791 330 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ANP32DO95626 131 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RGS7P49802 495 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ITIH3Q06033 890 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP1Q07960 439 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HADHQ16836 314 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DENND2CQ68D51 928 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 JADE1Q6IE81 842 aa8.24□□□□□ -1.09
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TRPS1-208ENST00000519076 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.24□□□□□ -1.09
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TRPS1-208ENST00000519076 ASB3Q9Y575 518 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP69A5D8W1 941 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GPR25O00155 361 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 IL18RAPO95256 599 aa8.23□□□□□ -1.09
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TRPS1-208ENST00000519076 MYBL1P10243 752 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KRT3P12035 628 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 IL4RP24394 825 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MLH1P40692 756 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SLCO1A2P46721 670 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HES6Q96HZ4 224 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SELENOSQ9BQE4 189 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 COX16Q9P0S2 106 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 VNN1O95497 513 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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TRPS1-208ENST00000519076 AKAP5P24588 427 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CHRNA3P32297 505 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RBP5P82980 135 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NNTQ13423 1086 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MTMR3Q13615 1198 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 JAMLQ86YT9 394 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PPTC7Q8NI37 304 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HSPH1Q92598 858 aa8.23□□□□□ -1.09
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