RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRF7	Q92985	503 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF263	O14978	683 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	NBL1	P41271	181 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASPA	P45381	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	GCLM	P48507	274 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAM9	Q13443	819 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAF12	Q16514	161 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MON1A	Q86VX9	555 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHFR	Q96EP1	664 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	GSDMA	Q96QA5	445 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	FRYL	O94915	3013 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOBP	A7XYQ1	873 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014		A8MXQ7	604 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014		F8VP50	259 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	BMP6	P22004	513 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFX1	P22670	979 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRIK1	P39086	918 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOX9	P48436	509 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNK2	Q07912	1038 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADSSL1	Q8N142	457 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24	9e-7	■■■■■ 115.4
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2orf78	A6NCI8	922 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIK3CA	P42336	1068 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZXDB	P98169	803 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ORC1	Q13415	861 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAF4B	Q92750	862 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	HPS4	Q9NQG7	708 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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