RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR158	Q5T848	1215 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MTMR9	Q96QG7	549 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ARID3A	Q99856	593 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS45	Q9NRW7	570 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD18	B2RXH4	712 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF19	O95750	216 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF9	P0C862	333 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXC13	P31276	330 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX3	P56589	373 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TNK2	Q07912	1038 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP4	Q13115	394 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ELF2	Q15723	593 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF12	Q16514	161 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM209	Q96SK2	561 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	MDFI	Q99750	246 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	EDEM2	Q9BV94	578 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	STIM2	Q9P246	746 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TM4SF5	O14894	197 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PFKFB2	O60825	505 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	MCF2	P10911	925 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNE1	P15382	129 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	RPA1	P27694	616 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRR2	P28476	465 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CREB5	Q02930	508 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE4C	Q08493	712 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	XKR4	Q5GH76	650 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ITIH5	Q86UX2	942 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TMC8	Q8IU68	726 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEAL3	Q969E4	200 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6C75	A6NL08	312 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	C4orf47	A7E2U8	309 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP3	O75969	853 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOBTB1	O94844	696 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52Z1	P0C646	297 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GBP1	P32455	592 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ADH7	P40394	386 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	NPTX2	P47972	431 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	MCM2	P49736	904 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	AMPD2	Q01433	879 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	STRN3	Q13033	797 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ACAP1	Q15027	740 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PCSK7	Q16549	785 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOC4	Q96A65	974 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53

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