RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 CYB561D2O14569 222 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ABLIM1O14639 778 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 NDUFS2O75306 463 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ZNF217O75362 1048 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 OPRD1P41143 372 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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CBX1-205ENST00000495350 FOSBP53539 338 aa6.63□□□□□ -1.35
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CBX1-205ENST00000495350 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.63□□□□□ -1.35
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CBX1-205ENST00000495350 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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CBX1-205ENST00000495350 ZPBP2Q6X784 338 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CD302Q8IX05 232 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 FRMD1Q8N878 549 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 STKLD1Q8NE28 680 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PNKPQ96T60 521 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TIPINQ9BVW5 301 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 DNM3Q9UQ16 869 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 LAMA5O15230 3695 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 SPTA1P02549 2419 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 A0A087WV48 116 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CAPN8A6NHC0 703 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 MEI4A8MW99 385 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 J3QKU1 62 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 WNT7AO00755 349 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PPEF2O14830 753 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 OGTO15294 1046 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TADA3O75528 432 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 KAT7O95251 611 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 CER1O95813 267 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ADH1CP00326 375 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PLA2G2AP14555 144 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TCF3P15923 654 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 HDCP19113 662 aa6.62□□□□□ -1.35
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CBX1-205ENST00000495350 GRIA2P42262 883 aa6.62□□□□□ -1.35
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CBX1-205ENST00000495350 KDSRQ06136 332 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB6Q15916 424 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 WSCD1Q658N2 575 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 JADE1Q6IE81 842 aa6.62□□□□□ -1.35
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CBX1-205ENST00000495350 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 FOXJ1Q92949 421 aa6.62□□□□□ -1.35
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CBX1-205ENST00000495350 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 C2orf78A6NCI8 922 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 SFI1A8K8P3 1242 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 LEFTY2O00292 366 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 FLRT2O43155 660 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 PFKFB2O60825 505 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1-205ENST00000495350 GJB3O75712 270 aa6.61□□□□□ -1.35
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