RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494045.5

REXO4-206, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, human

TSL 3

Gene REXO4, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REXO4-206	ENST00000494045	MED10	Q9BTT4	135 aa		27.56	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		27.56	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		27.56	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	KCNH6	Q9H252	994 aa		27.56	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	GDE1	Q9NZC3	331 aa		27.56	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	CSH1	P0DML2	217 aa		27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	CSH2	P0DML3	217 aa		27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	CUL2	Q13617	745 aa		27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	GAREM2	Q75VX8	874 aa		27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	CISH	Q9NSE2	258 aa		27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		27.55	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	ANHX	E9PGG2	379 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	ATP8B3	O60423	1300 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	FGF19	O95750	216 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	CCDC130	P13994	396 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	ANXA13	P27216	316 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	CACNA2D1	P54289	1103 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	HTR4	Q13639	388 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	ZNF394	Q53GI3	561 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	PARM1	Q6UWI2	310 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	FAM35A	Q86V20	835 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	C12orf29	Q8N999	325 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	LMO3	Q8TAP4	145 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	NT5C1B	Q96P26	610 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	IL21	Q9HBE4	155 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		27.54	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045		F8VP50	259 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	TRIM66	O15016	1216 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	TCF15	Q12870	199 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	TDG	Q13569	410 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	FUK	Q8N0W3	1084 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	TTC39C	Q8N584	583 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	FGF14	Q92915	247 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	PHOX2B	Q99453	314 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		27.53	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	NOL4	O94818	638 aa		27.52	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		27.52	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	MTSS1L	Q765P7	747 aa		27.52	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	NXPE3	Q969Y0	559 aa		27.52	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	SPATA17	Q96L03	361 aa		27.52	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	C8orf48	Q96LL4	319 aa		27.52	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	GCNA	Q96QF7	691 aa		27.52	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
REXO4-206	ENST00000494045	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	CDC25C	P30307	473 aa		27.51	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	CYP4F8	P98187	520 aa		27.51	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	TYRO3	Q06418	890 aa		27.51	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		27.51	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		27.51	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		27.51	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	KXD1	Q9BQD3	176 aa		27.51	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		27.51	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	KRT82	Q9NSB4	513 aa		27.51	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	PTPRD	P23468	1912 aa		27.51	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	KCNJ18	B7U540	433 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	AP1G2	O75843	785 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	ADORA2B	P29275	332 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	KCNJ12	Q14500	433 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	MAN2A1	Q16706	1144 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	GPR158	Q5T848	1215 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	KCNK16	Q96T55	309 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	GCNT4	Q9P109	453 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		27.5	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	F11	P03951	625 aa		27.49	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	PTMS	P20962	102 aa		27.49	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	RAD23B	P54727	409 aa		27.49	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		27.49	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	RRAGA	Q7L523	313 aa		27.49	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		27.49	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		27.49	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		27.49	■■□□□ 1.99
REXO4-206	ENST00000494045	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99

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