RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 FAXDC2Q96IV6 333 aa13.52□□□□□ -0.25
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PRAME-213ENST00000492657 ZNF408Q9H9D4 720 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-213ENST00000492657 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.253e-6■■□□□ 14.2
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PRAME-213ENST00000492657 CILPO75339 1184 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-213ENST00000492657 CYP3A5P20815 502 aa13.51□□□□□ -0.25
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PRAME-213ENST00000492657 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-213ENST00000492657 PPEF2O14830 753 aa13.49□□□□□ -0.25
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PRAME-213ENST00000492657 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
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PRAME-213ENST00000492657 H3BRB1 525 aa13.49□□□□□ -0.25
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PRAME-213ENST00000492657 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
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PRAME-213ENST00000492657 ITGAVP06756 1048 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-213ENST00000492657 PTPN7P35236 360 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-213ENST00000492657 TNFAIP2Q03169 654 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-213ENST00000492657 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-213ENST00000492657 KIZQ2M2Z5 673 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-213ENST00000492657 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-213ENST00000492657 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-213ENST00000492657 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-213ENST00000492657 NPNTQ6UXI9 565 aa13.49□□□□□ -0.25
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