RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491658.1

TFRC-215, Transcript of transferrin receptor, human

TSL 5

Gene TFRC, Length 396 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFRC-215	ENST00000491658	PROK1	P58294	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	C21orf58	P58505	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	KRT17	Q04695	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	GBX1	Q14549	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	GRM3	Q14832	879 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658		H0YIZ8	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	TPP1	O14773	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ZBED1	O96006	694 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	HRG	P04196	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	NDUFB7	P17568	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	KCNA3	P22001	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	PDE6C	P51160	858 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	DGKE	P52429	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	GLG1	Q92896	1179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658		A1L4Q6	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ONECUT2	O95948	504 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	FES	P07332	822 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	BRAF	P15056	766 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ADORA2A	P29274	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	GALE	Q14376	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ZNF213	O14771	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67	2e-8	■■■□□ 16.1
TFRC-215	ENST00000491658	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	MYF5	P13349	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ATF3	P18847	181 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	FAM193A	P78312	1265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	CNGA2	Q16280	664 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	APIP	Q96GX9	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TFRC-215	ENST00000491658	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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