RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 AMHR2Q16671 573 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SLC27A1Q6PCB7 646 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 OSMRQ99650 979 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ANGPT2O15123 496 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D12O60347 775 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 KRT16P08779 473 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ACKR2O00590 384 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SYF2O95926 243 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CARSP49589 748 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PSMC6P62333 389 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ERVK-9P63128 1117 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CDCA5Q96FF9 252 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 RRAGCQ9HB90 399 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 RRN3Q9NYV6 651 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PROSCO94903 275 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 APOA4P06727 396 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 UGT3A1Q6NUS8 523 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TTC30BQ8N4P2 665 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PNMA5Q96PV4 448 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 FUCA2Q9BTY2 467 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 EXD1Q8NHP7 514 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PCMTD2Q9NV79 361 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SUPT3HO75486 399 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ALDH2P05091 517 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ZNF286BP0CG31 522 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ANO5Q75V66 913 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 RIOX2Q8IUF8 465 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 LRRC43Q8N309 656 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 UCMAQ8WVF2 138 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SERPINB12Q96P63 405 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 C2CD2LO14523 706 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 STX7O15400 261 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 HOMEZQ8IX15 550 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SLC4A9Q96Q91 983 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 L2HGDHQ9H9P8 463 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ADCY3O60266 1144 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 IL10P22301 178 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 RHBDL3P58872 404 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 MFSD10Q14728 455 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 FAM172AQ8WUF8 416 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 FAM198AQ9UFP1 575 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ARHGAP10A1A4S6 786 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ADM5C9JUS6 153 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP17.71■□□□□ 0.434e-7■■■■□ 19.6
NISCH-213ENST00000489895 GCNT1Q02742 428 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PGBD3Q8N328 593 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD7Q92527 254 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 INTS13Q9NVM9 706 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CXCL8P10145 99 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SARSP49591 514 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ACTRT1Q8TDG2 376 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ING2Q9H160 280 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 C2orf81A6NN90 581 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 H0Y3Z8 333 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CUL3Q13618 768 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 DNAL1Q4LDG9 190 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TLK2Q86UE8 772 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 FAM118BQ9BPY3 351 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 HIC1Q14526 733 aa17.71■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 TTLL9Q3SXZ7 439 aa17.71■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 MRNIPQ6NTE8 343 aa17.71■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 RGS9BPQ6ZS82 235 aa17.71■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 C4orf33Q8N1A6 199 aa17.71■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 KIAA0895Q8NCT3 520 aa17.71■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 VCPIP1Q96JH7 1222 aa17.71■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa17.71■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 CD274Q9NZQ7 290 aa17.71■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 NCAM2O15394 837 aa17.7■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 KLHL2O95198 593 aa17.7■□□□□ 0.42
NISCH-213ENST00000489895 TM4SF1P30408 202 aa17.7■□□□□ 0.42
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