RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	SP9	P0CG40	484 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	P4HA1	P13674	534 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TCF3	P15923	654 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2F1	P24903	491 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	LMO2	P25791	158 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP2R5D	Q14738	602 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	NELL1	Q92832	810 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf48	Q96LL4	319 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRD	Q9H2X0	955 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TDP1	Q9NUW8	608 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	NR3C1	P04150	777 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PRCP	P42785	496 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	AMPD2	Q01433	879 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	DDR2	Q16832	855 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ZACN	Q401N2	412 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ISM2	Q6H9L7	571 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	USP34	Q70CQ2	3546 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	F5	P12259	2224 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	BIN1	O00499	593 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PHACTR2	O75167	634 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	NRL	P54845	237 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	NCOA4	Q13772	614 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC32	Q14392	662 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOC4	Q96A65	974 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TNIP3	Q96KP6	325 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	COMMD8	Q9NX08	183 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	BICDL2	A1A5D9	508 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CETN3	O15182	167 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L7	P0C7H9	530 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CD72	P21854	359 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	NR2F2	P24468	414 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MYL6	P60660	151 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP4F8	P98187	520 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC63	Q05C16	580 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM9	Q13443	819 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MORC3	Q14149	939 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP135	Q66GS9	1140 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	UNC93A	Q86WB7	457 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PCED1B	Q96HM7	432 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM84A	Q96KN4	292 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	NCAN	O14594	1321 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM186A	A6NE01	2351 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MXQ7	604 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRN2	O75325	713 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF12	O95522	483 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PDGFRB	P09619	1106 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRNB1	P11230	501 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT13	P13646	458 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ANXA13	P27216	316 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF2H1	P32780	548 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	BIRC3	Q13489	604 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PDGFRL	Q15198	375 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF699	Q32M78	642 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ADSSL1	Q8N142	457 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		18.4	■□□□□ 0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms