RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MED25	Q71SY5	747 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	LAMB1	P07942	1786 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	PJA2	O43164	708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDKL5	O76039	1030 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZFPL1	O95159	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CD38	P28907	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTPN7	P35236	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDK17	Q00537	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHRND	Q07001	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	G2E3	Q7L622	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CEP290	O15078	2479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL16	Q14005	1332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941		A0A1B0GUL6	1792 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL1R1	P14778	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	FPR1	P21462	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	KLRK1	P26718	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	SREBF1	P36956	1147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCNJ4	P48050	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	MPP3	Q13368	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRKG1	Q13976	671 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	UGT8	Q16880	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYOC	Q99972	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941		A0A1B0GTW7	788 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	AKR1B10	O60218	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAB11FIP3	O75154	756 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	TAF5L	O75529	589 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	ENPP1	P22413	925 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	RARRES1	P49788	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAP2B	P61225	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	FOXF2	Q12947	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	FEZ1	Q99689	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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