RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475304.5

TAPBP-238, Transcript of TAP binding protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TAPBP, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAPBP-238	ENST00000475304	OSTM1	Q86WC4	334 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	ABI1	Q8IZP0	508 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	EXD1	Q8NHP7	514 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	SUSD3	Q96L08	255 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	HIPK3	Q9H422	1215 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	EHD2	Q9NZN4	543 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	TRAPPC3	O43617	180 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	RNF8	O76064	485 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	PSMA2	P25787	234 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	RFC2	P35250	354 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	COPS2	P61201	443 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	PDE4C	Q08493	712 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	SYT15	Q9BQS2	421 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	ACBD6	Q9BR61	282 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	DUSP16	Q9BY84	665 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	TRIM7	Q9C029	511 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	SCN5A	Q14524	2016 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304		E5RJQ4	531 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	ENPP3	O14638	875 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	ATP8B1	O43520	1251 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	KRT7	P08729	469 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	TNFRSF8	P28908	595 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	SLC6A3	Q01959	620 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	STIM2	Q9P246	746 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	PYGM	P11217	842 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	GPD1	P21695	349 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	MARCKSL1	P49006	195 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	CLCN6	P51797	869 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	ODF2	Q5BJF6	829 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	PMF1	Q6P1K2	205 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	CNPY3	Q9BT09	278 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TAPBP-238	ENST00000475304	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	PTPRD	P23468	1912 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	DPYSL4	O14531	572 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	FSCN2	O14926	492 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	CCDC130	P13994	396 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	NPR3	P17342	541 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	ADORA2B	P29275	332 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	CHRNA3	P32297	505 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	PCK1	P35558	622 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	GJA8	P48165	433 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	FAAP100	Q0VG06	881 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	IFT20	Q8IY31	132 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	FUK	Q8N0W3	1084 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	PNKP	Q96T60	521 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	KRT12	Q99456	494 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	UST	Q9Y2C2	406 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	FAM200B	P0CF97	657 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	PTPN7	P35236	360 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	GPNMB	Q14956	572 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	CYP1B1	Q16678	543 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TAPBP-238	ENST00000475304	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		18.19	■□□□□ 0.5

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