RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 TXNDC8Q6A555 127 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 PCED1BQ96HM7 432 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 CHRDQ9H2X0 955 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 PIEZO1Q92508 2521 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 A8MXQ7 604 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 CLSTN1O94985 981 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 PDE6CP51160 858 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 CCDC142Q17RM4 750 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 STKLD1Q8NE28 680 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 TAF4BQ92750 862 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 C8orf48Q96LL4 319 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 LMAN1LQ9HAT1 526 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 CACNA1HO95180 2353 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 USP17L7P0C7H9 530 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 PFKLP17858 780 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 CTHP32929 405 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 PPP3CCP48454 512 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 ENPEPQ07075 957 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 LRRC32Q14392 662 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 PPP2R5DQ14738 602 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 ZACNQ401N2 412 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 TNIP3Q96KP6 325 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 GKN1Q9NS71 199 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 R4GN57 208 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 TADA3O75528 432 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 LMNAP02545 664 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 CHRNB1P11230 501 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 KRT13P13646 458 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 NR2F2P24468 414 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 VAMP7P51809 220 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 NOP14P78316 857 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 DLG4P78352 724 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 MTAPQ13126 283 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 SV2AQ7L0J3 742 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 TRPC7Q9HCX4 862 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 RMND1Q9NWS8 449 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 CCL26Q9Y258 94 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 NME7Q9Y5B8 376 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 PATJQ8NI35 1801 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-205ENST00000467594 ATP8B3O60423 1300 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 DENND4CQ5VZ89 1909 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 KINO60870 393 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 VNN1O95497 513 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 CKMP06732 381 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 SOX9P48436 509 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 CCR3P51677 355 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 AMPD2Q01433 879 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 TNK2Q07912 1038 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 RUNX3Q13761 415 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 PDGFRLQ15198 375 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 ADSSL1Q8N142 457 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 ATRIPQ8WXE1 791 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 DPEP3Q9H4B8 488 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 ZSCAN32Q9NX65 697 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 F8VP50 259 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 AKAP3O75969 853 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 HDCP19113 662 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 NRLP54845 237 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 CDH8P55286 799 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 ADAM9Q13443 819 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-205ENST00000467594 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms