RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	MTHFR	P42898	656 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GPD2	P43304	727 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PLA2G4A	P47712	749 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TUB	P50607	506 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	BCAT1	P54687	386 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ZBED6	P86452	979 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	VEPH1	Q14D04	833 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CES5A	Q6NT32	575 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ARC	Q7LC44	396 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ACOT1	Q86TX2	421 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PALB2	Q86YC2	1186 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	KAT5	Q92993	513 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	NXPE3	Q969Y0	559 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	FAM161B	Q96MY7	647 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM209	Q96SK2	561 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	DNAJC7	Q99615	494 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SYT11	Q9BT88	431 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MIS12	Q9H081	205 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	IFNK	Q9P0W0	207 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CD207	Q9UJ71	328 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TTC28	Q96AY4	2481 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MYO7A	Q13402	2215 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PTPRS	Q13332	1948 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	HHLA1	C9JL84	531 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	EPHB6	O15197	1021 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CYP26A1	O43174	497 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ATP2C2	O75185	946 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TBX10	O75333	385 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	FBXO21	O94952	628 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	LRG1	P02750	347 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GLI1	P08151	1106 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	OR4Q2	P0C623	313 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GZMA	P12544	262 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TCF3	P15923	654 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	FER	P16591	822 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ATF6	P18850	670 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CD58	P19256	250 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	BDNF	P23560	247 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CYP2F1	P24903	491 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ACADSB	P45954	432 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	RAP1GAP	P47736	663 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GABRB2	P47870	512 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PSEN1	P49768	467 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PDE6C	P51160	858 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	KIF11	P52732	1056 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CDR2	Q01850	454 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	LRMP	Q12912	555 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	FAM35A	Q86V20	835 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MON1A	Q86VX9	555 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		6.26	□□□□□ -1.41

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