RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RASA4BC9J798 803 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RASA4O43374 803 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MGRN1O60291 552 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZWINTO95229 277 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 OAS1P00973 400 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ERBB2P04626 1255 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ARSEP51690 589 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MYL6P60660 151 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PLCB3Q01970 1234 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CNTN2Q02246 1040 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MYO1EQ12965 1108 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LAMC2Q13753 1193 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TTLL4Q14679 1199 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SETDB1Q15047 1291 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PDK2Q15119 407 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 BOLA3Q53S33 107 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 VSTM1Q6UX27 236 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SPATA21Q7Z572 469 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FUKQ8N0W3 1084 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PDIK1LQ8N165 341 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CCDC63Q8NA47 563 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RNF149Q8NC42 400 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CFAP61Q8NHU2 1237 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MCEEQ96PE7 176 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TBCBQ99426 244 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SLC40A1Q9NP59 571 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RNF186Q9NXI6 227 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 EURLQ9NYK6 297 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 C2CD2Q9Y426 696 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PLXNB2O15031 1838 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LRRD1A4D1F6 860 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SMIM23A6NLE4 172 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD65E5RJM6 399 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 E7ESA3 106 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 DNM1LO00429 736 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ABLIM1O14639 778 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TM9SF1O15321 606 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 DCTN3O75935 186 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FAM155BO75949 473 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 APOC2P02655 101 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CD58P19256 250 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 KDELR1P24390 212 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PSMA2P25787 234 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CHKAP35790 457 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SCNN1AP37088 669 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SLCO1A2P46721 670 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RBP5P82980 135 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GPS1Q13098 491 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MTFR1Q15390 333 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 HIF1AQ16665 826 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GALNTL6Q49A17 601 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 EFHC2Q5JST6 749 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LGSNQ5TDP6 509 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CYB5D1Q6P9G0 228 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 C17orf99Q6UX52 265 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TRABD2AQ86V40 505 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PASD1Q8IV76 773 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FBF1Q8TES7 1133 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 STK32AQ8WU08 396 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 HAUS1Q96CS2 278 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LRRC39Q96DD0 335 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.93□□□□□ -0.98
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