RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461849.1

RBM39-222, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-222	ENST00000461849	TASP1	Q9H6P5	420 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CBX8	Q9HC52	389 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	PTPRJ	Q12913	1337 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	BECN2	A8MW95	431 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CHAD	O15335	359 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	LAMTOR5	O43504	91 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	GLUL	P15104	373 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CLDN10	P78369	228 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CYP4F8	P98187	520 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	TRPC3	Q13507	836 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	FAM3C	Q92520	227 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CGRRF1	Q99675	332 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	ABCB6	Q9NP58	842 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CACNA1H	O95180	2353 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	PRR23A	A6NEV1	266 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	GABRD	O14764	452 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	PHACTR2	O75167	634 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	KRT13	P13646	458 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF18	P17022	549 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CYP2F1	P24903	491 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	AVPR1A	P37288	418 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	VAMP7	P51809	220 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	AP3M2	P53677	418 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	TNNC1	P63316	161 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	OSTM1	Q86WC4	334 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	MSANTD3	Q96H12	275 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	FANCL	Q9NW38	375 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	OBP2A	Q9NY56	170 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CDH9	Q9ULB4	789 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	STX10	O60499	249 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	SP9	P0CG40	484 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	WEE1	P30291	646 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	GTF2H1	P32780	548 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	GPR15	P49685	360 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	TPM4	P67936	248 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	DDR2	Q16832	855 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	LUZP1	Q86V48	1076 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	SYT15	Q9BQS2	421 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	SNX25	Q9H3E2	840 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	IL21	Q9HBE4	155 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	COL4A3	Q01955	1670 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	KCNJ18	B7U540	433 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	PDGFRB	P09619	1106 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	ANXA13	P27216	316 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	GRIK1	P39086	918 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RBM39-222	ENST00000461849	PLCB2	Q00722	1185 aa		14.73	□□□□□ -0.05

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