RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 UNC93AQ86WB7 457 aa21.81■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 SDCBP2Q9H190 292 aa21.81■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TASP1Q9H6P5 420 aa21.81■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 CLDN5O00501 218 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 PSMC3P17980 439 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 AVPR1AP37288 418 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 VIPR2P41587 438 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ORC1Q13415 861 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TTI2Q6NXR4 508 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 SHDQ96IW2 340 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 NME7Q9Y5B8 376 aa21.8■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 F8VP50 259 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 NOL4O94818 638 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC192P0DO97 292 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 GDI1P31150 447 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TTC39CQ8N584 583 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 SPATA17Q96L03 361 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 BCO2Q9BYV7 579 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 IL21Q9HBE4 155 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 DACH1Q9UI36 760 aa21.79■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 HEPACAM2A8MVW5 462 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF263O14978 683 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 FCARP24071 287 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 CBWD6Q4V339 395 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 FAM35AQ86V20 835 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 MLKLQ8NB16 471 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 SEMA4DQ92854 862 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 IRF7Q92985 503 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 C8orf48Q96LL4 319 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TRPV4Q9HBA0 871 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 HELZP42694 1942 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 AP1G2O75843 785 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ABL1P00519 1130 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ADORA2BP29275 332 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 FMO5P49326 533 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 VITQ6UXI7 678 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TTC16Q8NEE8 873 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 SLC35C1Q96A29 364 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 KRT82Q9NSB4 513 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 F11P03951 625 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC130P13994 396 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 AVPR2P30518 371 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 INCA1Q0VD86 236 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF394Q53GI3 561 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 TXNDC8Q6A555 127 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 POTEHQ6S545 545 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 CMTM8Q8IZV2 173 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 MYRFLQ96LU7 910 aa21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.75■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 KRBA1A5PL33 1030 aa21.75■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 LRRN2O75325 713 aa21.75■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SCAF8-204ENST00000461219 CKMP06732 381 aa21.75■■□□□ 1.07
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