RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 MED10Q9BTT4 135 aa22.07■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.07■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.07■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.07■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.07■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 F8VP50 259 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 GNA14O95837 355 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 CD58P19256 250 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 VIPR2P41587 438 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 FAM35AQ86V20 835 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 MLKLQ8NB16 471 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 C8orf48Q96LL4 319 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 MYRFLQ96LU7 910 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 TASP1Q9H6P5 420 aa22.06■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 CA14Q9ULX7 337 aa22.06■■□□□ 1.12
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VARS-218ENST00000459667 MBD3O95983 291 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 FMO5P49326 533 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 CACNA2D1P54289 1103 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 GRM2Q14416 872 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 VITQ6UXI7 678 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 E2F7Q96AV8 911 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 TWNKQ96RR1 684 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.05■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 CILPO75339 1184 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 TADA3O75528 432 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 CCDC130P13994 396 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 PFKPQ01813 784 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 GPT2Q8TD30 523 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 NCANO14594 1321 aa22.04■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.03■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 KRBA1A5PL33 1030 aa22.03■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.03■■□□□ 1.12
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VARS-218ENST00000459667 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.03■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.03■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 KRT82Q9NSB4 513 aa22.03■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 EHD2Q9NZN4 543 aa22.03■■□□□ 1.12
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VARS-218ENST00000459667 PRAMEF12O95522 483 aa22.02■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 WEE1P30291 646 aa22.02■■□□□ 1.12
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VARS-218ENST00000459667 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.02■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.02■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 TTC39CQ8N584 583 aa22.02■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.02■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 C12orf29Q8N999 325 aa22.02■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.02■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 MED15Q96RN5 788 aa22.02■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 BRD9Q9H8M2 597 aa22.02■■□□□ 1.12
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VARS-218ENST00000459667 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
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VARS-218ENST00000459667 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.01■■□□□ 1.11
VARS-218ENST00000459667 SOBPA7XYQ1 873 aa22.01■■□□□ 1.11
VARS-218ENST00000459667 PMM2O15305 246 aa22.01■■□□□ 1.11
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VARS-218ENST00000459667 RFX1P22670 979 aa22.01■■□□□ 1.11
VARS-218ENST00000459667 ADORA2BP29275 332 aa22.01■■□□□ 1.11
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VARS-218ENST00000459667 AVPR1AP37288 418 aa22.01■■□□□ 1.11
VARS-218ENST00000459667 CETN1Q12798 172 aa22.01■■□□□ 1.11
VARS-218ENST00000459667 KCNH2Q12809 1159 aa22.01■■□□□ 1.11
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