RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439407.1

LMCD1-AS1-202, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PRLRP16471 622 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NPR3P17342 541 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TCP1P17987 556 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 COMTP21964 271 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BDNFP23560 247 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CA8P35219 290 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GRIK1P39086 918 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PBX3P40426 434 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLC1A1P43005 524 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GABRB2P47870 512 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MAP3K7CLP57077 242 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLC6A3Q01959 620 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PLCB3Q01970 1234 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRT17Q04695 432 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PTP4A2Q12974 167 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PDCLQ13371 301 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 USP41Q3LFD5 358 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PTPN20Q4JDL3 420 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ODF2Q5BJF6 829 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TMEM240Q5SV17 173 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCDC181Q5TID7 509 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PMF1Q6P1K2 205 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM171BQ6P995 826 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM35AQ86V20 835 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TTC30AQ86WT1 665 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FUKQ8N0W3 1084 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CEP112Q8N8E3 955 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 STK32AQ8WU08 396 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MYLPFQ96A32 169 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 VWCEQ96DN2 955 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PCED1BQ96HM7 432 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IGSF21Q96ID5 467 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PBKQ96KB5 322 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TMEM209Q96SK2 561 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CPXM1Q96SM3 734 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TTPALQ9BTX7 342 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MARCH5Q9NX47 278 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPG21Q9NZD8 308 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HCSTQ9UBK5 93 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 INSL6Q9Y581 213 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.1□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MYH10P35580 1976 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TMEM191CA6NGB0 347 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 E5RJQ4 531 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TULP2O00295 520 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KCNK3O14649 394 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CEP104O60308 925 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SRGAP2O75044 1071 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GRAP2O75791 330 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RNF8O76064 485 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PROSCO94903 275 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 OR4Q2P0C623 313 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CPB1P15086 417 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GPD1P21695 349 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FGFR3P22607 806 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PSMA2P25787 234 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CETN2P41208 172 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PKDCCQ504Y2 493 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.09□□□□□ -1.27
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms