RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 DEF6Q9H4E7 631 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 ABCB6Q9NP58 842 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CEP83Q9Y592 693 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CHRNB2P17787 502 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TNFAIP3P21580 790 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 ELF1P32519 619 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 BCAT1P54687 386 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SLC8A3P57103 927 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CDK17Q00537 523 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 DUSP4Q13115 394 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TTC30AQ86WT1 665 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TLE6Q9H808 572 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 PRRG1O14668 218 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SPATA31D3P0C874 917 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 NPR3P17342 541 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CLCN4P51793 760 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SYT11Q9BT88 431 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 DUSP16Q9BY84 665 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 GRIK1P39086 918 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 NRIP1P48552 1158 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CACNA2D1P54289 1103 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K7CLP57077 242 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 VSTM1Q6UX27 236 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC42Q96M95 316 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 FAM170AA1A519 330 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SEC24AO95486 1093 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 FECHP22830 423 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 MAGEA11P43364 429 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 PDE4CQ08493 712 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 PKDCCQ504Y2 493 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 LILRA6Q6PI73 481 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TMTC1Q8IUR5 882 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SMOQ99835 787 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 MAFFQ9ULX9 164 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 F8VP50 259 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM66O15016 1216 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 AKR1B10O60218 316 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SOAT2O75908 522 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 BEST1O76090 585 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SETSIPP0DME0 302 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 ANXA13P27216 316 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 DUSP6Q16828 381 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 LIN9Q5TKA1 542 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 GUCD1Q96NT3 240 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 KCNK16Q96T55 309 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 LHX5Q9H2C1 402 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 NRDCO43847 1150 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 EPCAMP16422 314 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 IGFBP4P22692 258 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 GPD2P43304 727 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 GPR15P49685 360 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TCEAL5Q5H9L2 206 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 NAA35Q5VZE5 725 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM139Q8IV31 216 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms