RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427759.5

ATG7-208, Transcript of autophagy related 7, human

TSL 3

Gene ATG7, Length 455 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG7-208	ENST00000427759	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	BLACE	A4D250	179 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TOR1B	O14657	336 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PLOD3	O60568	738 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	MBD4	O95243	580 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	ICAM1	P05362	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	GNAT1	P11488	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	RAC2	P15153	192 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	KLRC2	P26717	231 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	MCM4	P33991	863 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	CXADR	P78310	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	MPP1	Q00013	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TRIM14	Q14142	442 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	DOC2B	Q14184	412 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	LRRC43	Q8N309	656 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TTC9	Q92623	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PHKB	Q93100	1093 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TTC1	Q99614	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PTPRD	P23468	1912 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	MTOR	P42345	2549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759		A0A1W2PQH9	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	DCLK1	O15075	740 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	EXTL3	O43909	919 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	B4GALT3	O60512	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PHACTR2	O75167	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	IDE	P14735	1019 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	SNX16	P57768	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	RHD	Q02161	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7-208	ENST00000427759	PRR16	Q569H4	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms