RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417797.1

USP9YP13-201, Transcript of USP9Y pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP13, Length 480 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP13-201ENST00000417797 FMO1Q01740 532 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 CNGA2Q16280 664 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 PLA1AQ53H76 456 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 CCDC149Q6ZUS6 474 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ATG4AQ8WYN0 398 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 SARAFQ96BY9 339 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 APIPQ96GX9 242 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ASB6Q9NWX5 421 aa4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 TMEM233B4DJY2 109 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ONECUT2O95948 504 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 BRAFP15056 766 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 RHCEP18577 417 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 KCNA3P22001 575 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 LIPAP38571 399 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 RHDQ02161 417 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 SEMA5AQ13591 1074 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 KIAA0753Q2KHM9 967 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 AKNAD1Q5T1N1 836 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 DGKHQ86XP1 1220 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 MPP5Q8N3R9 675 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 OR56A3Q8NH54 315 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 HAPLN3Q96S86 360 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 CPNE5Q9HCH3 593 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ARHGEF3Q9NR81 526 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 PTGFRNQ9P2B2 879 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ADAM21Q9UKJ8 722 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa4.49□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ERBB2P04626 1255 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 DRD4P21917 467 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 PEX2P28328 305 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ALDH9A1P49189 494 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 CCT8P50990 548 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 PDE6CP51160 858 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 KRT17Q04695 432 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 TREML2Q5T2D2 321 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ANKRD16Q6P6B7 361 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 RASAL3Q86YV0 1011 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 GLG1Q92896 1179 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 SPSB4Q96A44 273 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 MSLNLQ96KJ4 702 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 GLOD4Q9HC38 313 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 COL20A1Q9P218 1284 aa4.48□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 A1L4Q6 167 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 MGEA5O60502 916 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 C1RP00736 705 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 EBLN1P0CF75 366 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 RPL17P18621 184 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 GPD1P21695 349 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 KLRC1P26715 233 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 CLCN2P51788 898 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 FAM153CQ494X1 144 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 SYCE2Q6PIF2 218 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 SESTD1Q86VW0 696 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 SOCS4Q8WXH5 440 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 TIFAQ96CG3 184 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 C8orf48Q96LL4 319 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.47□□□□□ -1.69
USP9YP13-201ENST00000417797 H0YIZ8 118 aa4.46□□□□□ -1.7
USP9YP13-201ENST00000417797 KIF3BO15066 747 aa4.46□□□□□ -1.7
USP9YP13-201ENST00000417797 CCP110O43303 1012 aa4.46□□□□□ -1.7
USP9YP13-201ENST00000417797 TJP3O95049 919 aa4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms