RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 EXD1Q8NHP7 514 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 ABL2P42684 1182 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 ZNF132P52740 706 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 CCNG2Q16589 344 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 KIZQ2M2Z5 673 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 FAM47EQ6ZV65 393 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 FAM167AQ96KS9 214 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 NEU2Q9Y3R4 380 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 LIASO43766 372 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 AGTP01019 485 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 ERBB2P04626 1255 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 GJA5P36382 358 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 CETN2P41208 172 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 NPNTQ6UXI9 565 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 CCDC89Q8N998 374 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 RUNDC3BQ96NL0 473 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.86■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.85■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.85■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 ACTL9Q8TC94 416 aa21.85■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.85■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.85■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 CALB1P05937 261 aa21.85■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 MAGEA4P43358 317 aa21.85■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.85■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.85■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 F5H423 210 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 MXRA7P84157 204 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 TAF11Q15544 211 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 CNGA2Q16280 664 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 DPPA5A6NC42 116 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 TTLL4Q14679 1199 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 NETO2Q8NC67 525 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 LRCH4O75427 683 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 TJP3O95049 919 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 LGALS2P05162 132 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 RAD23BP54727 409 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa21.83■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 PPEF2O14830 753 aa21.83■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.83■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 SESTD1Q86VW0 696 aa21.83■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 RFX6Q8HWS3 928 aa21.83■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.83■■□□□ 1.09
SPRN-201ENST00000414069 POLE2P56282 527 aa21.83■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 VSTM1Q6UX27 236 aa21.83■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 SPOCK2Q92563 424 aa21.83■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 RASA4BC9J798 803 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 GOLGA8RI6L899 631 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 RASA4O43374 803 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 ADORA2AP29274 412 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 GBP1P32455 592 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 TFDP1Q14186 410 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 TAOK1Q7L7X3 1001 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 RCOR2Q8IZ40 523 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 C7orf31Q8N865 590 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 KCTD6Q8NC69 237 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 EPAS1Q99814 870 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 ZFATQ9P243 1243 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 TUBP50607 506 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 TFDP3Q5H9I0 405 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 FAXCQ5TGI0 409 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 UBR7Q8N806 425 aa21.82■■□□□ 1.08
SPRN-201ENST00000414069 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms