RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.89■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC150Q8NCX0 1101 aa15.89■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SMARCD2Q92925 531 aa15.89■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ELSPBP1Q96BH3 223 aa15.89■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 TNIP3Q96KP6 325 aa15.89■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 GCNAQ96QF7 691 aa15.89■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CYP3A43Q9HB55 503 aa15.89■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 FAM49BQ9NUQ9 324 aa15.89■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 FBXL21Q9UKT6 434 aa15.89■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 COL4A3Q01955 1670 aa15.89■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 KRBA1A5PL33 1030 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CILPO75339 1184 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 PRAMEF12O95522 483 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 COL9A1P20849 921 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 VITQ6UXI7 678 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 UNC93AQ86WB7 457 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM59Q8IWR1 403 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 FUKQ8N0W3 1084 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SIX5Q8N196 739 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CRYBG2Q8N1P7 616 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 C12orf29Q8N999 325 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA17Q96L03 361 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 MYRFLQ96LU7 910 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 MED10Q9BTT4 135 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 TRPV4Q9HBA0 871 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ZFP14Q9HCL3 533 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CA14Q9ULX7 337 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 GREB1Q4ZG55 1949 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM66O15016 1216 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ANXA13P27216 316 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 VCPP55072 806 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 LRMPQ12912 555 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 WDR44Q5JSH3 913 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 FBXL6Q8N531 539 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 MLKLQ8NB16 471 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf48Q96LL4 319 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 GPR88Q9GZN0 384 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 TASP1Q9H6P5 420 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 KRT82Q9NSB4 513 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF318Q5VUA4 2279 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 AP1G2O75843 785 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 BEST1O76090 585 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 GNA14O95837 355 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 NPR3P17342 541 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 KCNH2Q12809 1159 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF394Q53GI3 561 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 TXNDC8Q6A555 127 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 IRF2BP1Q8IU81 584 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC3BQ96PB8 259 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 KCNK16Q96T55 309 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SMOQ99835 787 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CISHQ9NSE2 258 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 WNT16Q9UBV4 365 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 KMT2EQ8IZD2 1858 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 PMM2O15305 246 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ADORA2BP29275 332 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CUL2Q13617 745 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 FLCNQ8NFG4 579 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 LMO3Q8TAP4 145 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 KAT5Q92993 513 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SMARCD1Q96GM5 515 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CEP295NLQ96MC4 621 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF3Q9NR81 526 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ATP8B3O60423 1300 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 COL4A2P08572 1712 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 AFPP02771 609 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC192P0DO97 292 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 PSMC3P17980 439 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 GDI1P31150 447 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms