RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356537.8

CCDC25-201, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC25, Length 3,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-201ENST00000356537 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 C2CD4BA6NLJ0 364 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 ACSL3O95573 720 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 CYP2C9P11712 490 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 ITIH2P19823 946 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 CYP2B6P20813 491 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 IL4RP24394 825 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 GCAP28676 217 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 PTGISQ16647 500 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 LONRF1Q17RB8 773 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 CYP4X1Q8N118 509 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC25-201ENST00000356537 LRRD1A4D1F6 860 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 SMIM23A6NLE4 172 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 VDRP11473 427 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 KDELR1P24390 212 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 RGS7P49802 495 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 RBP5P82980 135 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 KYNUQ16719 465 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 QPCTQ16769 361 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 XKR4Q5GH76 650 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 BCAS4Q8TDM0 211 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PGM2Q96G03 612 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 CFAP57Q96MR6 1250 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PLVAPQ9BX97 442 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PIRO00625 290 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 MED7O43513 233 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 BANF1O75531 89 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 ENDOD1O94919 500 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PSEN2P49810 448 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 P3H1Q32P28 736 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 DENND2CQ68D51 928 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 SLC35F5Q8WV83 523 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 TMEM109Q9BVC6 243 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 EURLQ9NYK6 297 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 CCT5P48643 541 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PPP2R2AP63151 447 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 DYNLT1P63172 113 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 TAP1Q03518 808 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 CCDC14Q49A88 953 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 CCDC38Q502W7 563 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 RRN3P2A6NIE6 340 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 ADCY8P40145 1251 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 MMP13P45452 471 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 IFNL1Q8IU54 200 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 APOL6Q9BWW8 343 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PARP2Q9UGN5 583 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 PTGESO14684 152 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 TTC4O95801 387 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 CCDC130P13994 396 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 TKTP29401 623 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 COPS2P61201 443 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 NOTUMQ6P988 496 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 NPNTQ6UXI9 565 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 ACTL9Q8TC94 416 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC25-201ENST00000356537 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms