RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341472.9

SYNE2-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNE2, Length 1,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE2-201ENST00000341472 CLSTN1O94985 981 aa21.51■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.51■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 ZNF699Q32M78 642 aa21.51■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.51■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 EHD2Q9NZN4 543 aa21.5■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 NFIL3Q16649 462 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.49■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.49■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.49■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.48■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 NR2F2P24468 414 aa21.48■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 TAF4BQ92750 862 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 CHRDQ9H2X0 955 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 F8VP50 259 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 TADA3O75528 432 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 AKAP3O75969 853 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 USP17L7P0C7H9 530 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 KRT13P13646 458 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 HDCP19113 662 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 CTHP32929 405 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 TNIP3Q96KP6 325 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 IER2Q9BTL4 223 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 CKMP06732 381 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 RAP1GAPP47736 663 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 LRRC32Q14392 662 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE2-201ENST00000341472 RMND1Q9NWS8 449 aa21.46■■□□□ 1.03
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SYNE2-201ENST00000341472 PDE6CP51160 858 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 USP46P62068 366 aa21.45■■□□□ 1.02
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SYNE2-201ENST00000341472 RUNX3Q13761 415 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 PDGFRLQ15198 375 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 ADSSL1Q8N142 457 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 SLC22A12Q96S37 553 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 MED10Q9BTT4 135 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 SDCBP2Q9H190 292 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE2-201ENST00000341472 GCNT4Q9P109 453 aa21.45■■□□□ 1.02
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