RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 SIK3Q9Y2K2 1263 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1B0GTH6 734 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CSH1P0DML2 217 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CSH2P0DML3 217 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC130P13994 396 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 UCHL3P15374 230 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 SYCP1Q15431 976 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 SGO2Q562F6 1265 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP17Q68EM7 881 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 GIPC2Q8TF65 315 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CORO1BQ9BR76 489 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 POMKQ9H5K3 350 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 PRKAG3Q9UGI9 489 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CDH22Q9UJ99 828 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CLUHO75153 1309 aa28.39■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF197O14709 1029 aa28.39■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 RHOP08100 348 aa28.39■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 KRT5P13647 590 aa28.39■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 IL9P15248 144 aa28.39■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 TJAP1Q5JTD0 557 aa28.39■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 SHC3Q92529 594 aa28.39■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 ASAH2Q9NR71 780 aa28.39■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa28.39■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 DENND4AQ7Z401 1863 aa28.39■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 TEX33O43247 280 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 AP1G2O75843 785 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 FGF19O95750 216 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 FAM200BP0CF97 657 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 CD19P15391 556 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 ADORA2BP29275 332 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 GPR15P49685 360 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 UBASH3AP57075 661 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 NR1I3Q14994 352 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 NEK11Q8NG66 645 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 STK33Q9BYT3 514 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 EHD2Q9NZN4 543 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 F8VP50 259 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 FSHRP23945 695 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 USP8P40818 1118 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF132P52740 706 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 EPHA5P54756 1037 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 RAPGEF1Q13905 1077 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 STILQ15468 1287 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 RNF214Q8ND24 703 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 GPR152Q8TDT2 470 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 KRT82Q9NSB4 513 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 NR2E1Q9Y466 385 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 FHOD1Q9Y613 1164 aa28.37■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 SLC38A8A6NNN8 435 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 NOL4O94818 638 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 MICAL2O94851 1124 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 KLK7P49862 253 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 SLC8A3P57103 927 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 NTHL1P78549 312 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 SDHAF4Q5VUM1 108 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 DUSP16Q9BY84 665 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 GANQ9H2C0 597 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 USTQ9Y2C2 406 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 DENND4CQ5VZ89 1909 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 DOCK8Q8NF50 2099 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PQC6 194 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 CACNA2D1P54289 1103 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 CNGA2Q16280 664 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 OTOP3Q7RTS5 596 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 ADHFE1Q8IWW8 467 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 HS6ST3Q8IZP7 471 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD52Q8NB46 1076 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 KCNK16Q96T55 309 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 SMOQ99835 787 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC3Q9BY71 257 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 HESX1Q9UBX0 185 aa28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 C5orf42Q9H799 3197 aa28.34■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 MYL4P12829 197 aa28.34■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 BPIFB4P59827 614 aa28.34■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CRIP1-201ENST00000330233 LCLAT1Q6UWP7 414 aa28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms