RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 WNT6Q9Y6F9 365 aa26.82■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC30A4O14863 429 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 STX6O43752 255 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 GDF9O60383 454 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 DRD1P21728 446 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 LMO2P25791 158 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 GJA4P35212 333 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNB1Q14721 858 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF77Q15935 545 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 DUOXA2Q1HG44 320 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 OSCP1Q8WVF1 389 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 MYLPFQ96A32 169 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 MMS19Q96T76 1030 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 TNMDQ9H2S6 317 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 ECT2Q9H8V3 914 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 HSPBP1Q9NZL4 362 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 CDH9Q9ULB4 789 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 C2orf78A6NCI8 922 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 PDGFRBP09619 1106 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNA4P22459 653 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 ASIC1P78348 528 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP27A1Q02318 531 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 USP4Q13107 963 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 PSMD2Q13200 908 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC6Q16204 474 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM171BQ6P995 826 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 DPH6Q7L8W6 267 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP2A3Q93084 1043 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 HHIPQ96QV1 700 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 BDNFP23560 247 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 GRIK1P39086 918 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 MAGEA11P43364 429 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 PPM1JQ5JR12 505 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 KBTBD6Q86V97 674 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 RDH13Q8NBN7 331 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 SH3RF2Q8TEC5 729 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 DHX58Q96C10 678 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 CRTAC1Q9NQ79 661 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 SPTLC2O15270 562 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 DLATP10515 647 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 HDCP19113 662 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 ANXA13P27216 316 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR49Q8IV35 697 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 CD101Q93033 1021 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM9Q9C026 710 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1586Q9HCI6 787 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 TNNI1P19237 187 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 AMPD3Q01432 767 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 EML3Q32P44 896 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXO43Q4G163 708 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 VSTM1Q6UX27 236 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 GCNT4Q9P109 453 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4R4-202ENST00000328839 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 WARSP23381 471 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 HOXD13P35453 343 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 NR1H3Q13133 447 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 E2F4Q16254 413 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 LIMS2Q7Z4I7 341 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 CAMKK1Q8N5S9 505 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATA17Q96L03 361 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 FNBP1Q96RU3 617 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 SNX25Q9H3E2 840 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 CUEDC2Q9H467 287 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 EPN2O95208 641 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 PDE6CP51160 858 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP2J2P51589 502 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 MDH1BQ5I0G3 518 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 HS2ST1Q7LGA3 356 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 PCED1BQ96HM7 432 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 LOXL4Q96JB6 756 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 LINC00597Q9H2U6 94 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms