RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 HAUS1Q96CS2 278 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 RASA4BC9J798 803 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 RASA4O43374 803 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 CD48P09326 243 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 FOXN2P32314 431 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 PHKA2P46019 1235 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 MTFR1Q15390 333 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 TRNP1Q6NT89 227 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 CENPUQ71F23 418 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 SULF1Q8IWU6 871 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 SENP1Q9P0U3 644 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 CST8O60676 142 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 APOC2P02655 101 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 MYO1EQ12965 1108 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 TMED2Q15363 201 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ILDR2Q71H61 639 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 MZB1Q8WU39 189 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 PEBP4Q96S96 227 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 SGK1O00141 431 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 SMAPO00193 183 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 TYROBPO43914 113 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 LGALS2P05162 132 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 VDRP11473 427 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 CD19P15391 556 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 CYP3A5P20815 502 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 MIPP30301 263 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 PSMC4P43686 418 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 KYAT1Q16773 422 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 RNF43Q68DV7 783 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 SPATA21Q7Z572 469 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 EMC1Q8N766 993 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 KATNBL1Q9H079 304 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ZWILCHQ9H900 591 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ASB14A6NK59 587 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 INSRRP14616 1297 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 MSS51Q4VC12 460 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 FAM228AQ86W67 206 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 GDAP1Q8TB36 358 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 C2CD2Q9Y426 696 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 SUN1O94901 812 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 PFKMP08237 780 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 KRT19P08727 400 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 TSHRP16473 764 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 STX2P32856 288 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 GAD2Q05329 585 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 MGAT5Q09328 741 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 BNIP1Q12981 228 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 HIF1AQ16665 826 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ARMCX2Q7L311 632 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4C-201ENST00000317868 A0A087WZ62 844 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG4C-201ENST00000317868 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG4C-201ENST00000317868 OSBPP22059 807 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG4C-201ENST00000317868 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ATG4C-201ENST00000317868 ORC1Q13415 861 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms