RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	HAS1	Q92839	578 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	KIAA1191	Q96A73	305 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	STK31	Q9BXU1	1019 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	INTS13	Q9NVM9	706 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	DMTF1	Q9Y222	760 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175		A0A087WZ62	844 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PIPSL	A2A3N6	862 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	BTBD11	A6QL63	1104 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PRRG2	O14669	202 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	MATN3	O15232	486 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	THAP12	O43422	761 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	KCNQ3	O43525	872 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CSF1R	P07333	972 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SETSIP	P0DME0	302 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PPP3CB	P16298	524 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	KCNA3	P22001	575 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	MYO1E	Q12965	1108 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	KRT72	Q14CN4	511 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	VPS53	Q5VIR6	699 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	LAYN	Q6UX15	382 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	BEND5	Q7L4P6	421 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SSH3	Q8TE77	659 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF384	Q8TF68	577 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	NELL2	Q99435	816 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	GPR20	Q99678	358 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF747	Q9BV97	191 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	MLST8	Q9BVC4	326 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CERS4	Q9HA82	394 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	DKK4	Q9UBT3	224 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175		F5H697	171 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	TRIAP1	O43715	76 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	RASSF9	O75901	435 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	INMT	O95050	263 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	MYL4	P12829	197 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ABCB4	P21439	1286 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CD6	P30203	668 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PPM1A	P35813	382 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	HSPA7	P48741	367 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CPT1A	P50416	773 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ARHGEF7	Q14155	803 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SLC29A2	Q14542	456 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	INSC	Q1MX18	579 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	MPEG1	Q2M385	716 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ICE2	Q659A1	982 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	VWA1	Q6PCB0	445 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	RNF44	Q7L0R7	432 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	LPIN2	Q92539	896 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	FAM136A	Q96C01	138 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	STK33	Q9BYT3	514 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-223	ENST00000637175	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		3.74	□□□□□ -1.81

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