RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CNPY3Q9BT09 278 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MUC3BQ9H195 1237 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NEMP1O14524 444 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CYB561D2O14569 222 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NCAM2O15394 837 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 RBP3P10745 1247 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 THPOP40225 353 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC138Q96M89 665 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MYO1CO00159 1063 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PRRG1O14668 218 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MGEA5O60502 916 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PYGLP06737 847 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GCKP35557 465 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 HSD17B3P37058 310 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 E2F5Q15329 346 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MEA1Q16626 185 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 REPS2Q8NFH8 660 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CISHQ9NSE2 258 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TTC36A6NLP5 189 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CYTH3O43739 400 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PGK2P07205 417 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PAX3P23760 479 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SLC11A2P49281 568 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CLCN3P51790 818 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 IL31Q6EBC2 164 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NCLNQ969V3 563 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 WDR18Q9BV38 432 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF197O14709 1029 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PSMD10O75832 226 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 AP1G2O75843 785 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 THP07101 528 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PSMC6P62333 389 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CPB2Q96IY4 423 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NAT9Q9BTE0 207 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TEX12Q9BXU0 123 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 M0QYT0 321 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC6O75061 913 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFS3O75489 264 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ESRRBO95718 433 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 HADHAP40939 763 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PTGER2P43116 358 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 HDAC4P56524 1084 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 HIC1Q14526 733 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CDYLQ9Y232 598 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087X0B3 334 aa6.73□□□□□ -1.33
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